В последние годы музей принимал активное участие в формировании международных выставок и современных образовательных социально-культурных программах.В 2005 году в Татарстане в рамках проекта «Музеи России – 1000-летию Казани в государственном историко-архитектурном и художественном музее-заповеднике “Казанский кремль” археологические предметы фондовой коллекции астраханского музея-заповедника, относящиеся к 13-14 векам, экспонировались на выставке “Золотая Орда. История и культура” совместно с редчайшими экспонатами из коллекций Эрмитажа. Фотография мозаичного тондо с персидской надписью из астраханской коллекции золотоордынской кашинной керамики 14 века обошла все каталоги и буклеты, изданные под патронажем Эрмитажа. Осенью 2005 года по инициативе сотрудников Астраханского государственного объединенного историко-архитектурного музея-заповедника в с. Алтынжар Астраханской области был открыт межгосударственный культурный Центр имени Курмангазы. Здесь располагается гостиничный комплекс, музей Курмангазы Сагырбаева, музыкальная школа домбристов… Решение о возведении комплекса и финансировании проекта было принято казахстанской и российской сторонами при поддержке казахского национального общества астраханской области «Жолдастык». Выступив инициатором масштабного межгосударственного проекта, музей-заповедник получил в результате музей-филиал, отвечающий всем современным требованиям.