Фондовая работа с коллекциями велась с момента образования Хабаровского краевого краеведческого музея им. Н.И. Гродекова. В начале ХХ века систематизацией и научной обработкой фондовых коллекций, составлением списков коллекций, каталогов занимались все сотрудники музея, в том числе директор В. К. Арсеньев. Существовала должность консерватора музея. В 1914 году ее занимал В. В. Домбровский. Он тоже принимал активное участие в систематизации и описании музейных коллекций.

В 1932 году остро встал вопрос о систематизации фондовых коллекций. С этой целью с 15 декабря 1934 года в штатное расписание музея была введена должность заведующего фондами, на которую с окладом научного работника принят Черноусов . С 9 ноября 1942 года по 15 сентября 1948 года заведующей фондами была Лидия Николаевна Мисюра, с 16 июня 1948 года фонды музея приняла Валентина Ивановна Воропаева . С 14 августа 1950 года заведующей (хранителем) фондами назначена П. А. Говзман . Она была членом КПСС, имела неоконченное высшее образование . В 1976 году на эту должность была принята Т. А. Кондратова . Впоследствии должность заведующего фондами была преобразована в должность главного хранителя фондов.

С 1980 по 1986 годы штатная численность фондовой группы ХККМ составляла 3 человека: главный хранитель, старший научный сотрудник, младший научный сотрудник (или научный сотрудник). В 1987 году количество сотрудников увеличилось до 4-х человек. В 1988 году в составе фондовой группы создан сектор учета и появилась должность заведующего сектором учета. В 2002 году сектор преобразован в отдел учета фондов. В 1994 году создан сектор фото - документального фонда, в 2002 году он преобразован в отдел. В 2002 году в структуре фондовой группы был образован отдел хранения фондов.

С 1 июня 1989 года в штате Хабаровского краевого краеведческого музея им. Н.И. Гродекова появилась должность художника-реставратора. В 1997 году создан сектор реставрации, в 2001 году - реставрационная группа, в 2002 году - отдел реставрации.

С 2001 года главным хранителем музея является Мельникова Татьяна Владимировна, кандидат исторических наук, хранитель этнографической коллекции ХККМ.