Историко-бытовая коллекция насчитывает более 2000 единиц хранения и включает в себя следующие разделы: предметы быта и домашнего обихода (самовары, посуда, утюги), собрание церковной утвари, коллекция предметов с Салехардского рыбоконсервного завода, предметы с 501 стройки, коллекция фотоаппаратов, кинопленок и грампластинок, оружия, нумизматическая коллекция. В 2006 году, сотрудником Государственного музея Вооруженных сил РФ (г. Москва) Савиновым А.Ю. была атрибутирована коллекция оружия. Несмотря на небольшое количество предметов, она по своему качеству и разнообразию очень интересна, и, по словам специалистов, «сделает честь любому известному музею». Данная коллекция представлена оружием XVII – XIX вв. Наиболее интересны в ней – нарезная пищаль XVII в., используемая как «крепостная», применявшаяся для обороны крепости, кремневые охотничьи гладкоствольные ружья XVII в., предназначенные для индивидуального бойца, парадная шпага XIX в. производства Великобритании, на которой есть имя владельца – «Дж. Дж. Пэйдж», клеймо производителя и вензель на ножнах.

Коллекция предметов по истории строительства железной дороги на Ямале в 1940 – 50-х годах включает в себя подлинные экспонаты, собранные на территории округа в местах бывшего расположения лагерей 501 стройки. По эмоциональному воздействию это наиболее сильная часть музейных фондов. Каждый предмет этой коллекции рассказывает о судьбе людей, по тем или иным причинам оказавшихся неугодным Советской власти. Из документальной части этой коллекции большой интерес для посетителей и исследователей представляет личный фонд Дмитрия Жигина, начальника Северного управления строительством железной дороги. Здесь представлены документы из личного и семейного архива Жигина, служебная документация от начала строительства и до его ликвидации.