Богатую и разнообразную культуру северных народов (ненцев, ханты, коми, селькупов) отражают экспонаты этнографического фонда, достоянием которого являются экспонаты XIX – XX веков. Среди них – большая коллекция национальной одежды, предметы быта, религиозного культа, декоративно-прикладного творчества этих народов. Богатую и разнообразную культуру северных народов (ненцев, ханты, коми, селькупов) отражают экспонаты этнографического фонда, достоянием которого являются экспонаты XIX – XX веков. Среди них – большая коллекция национальной одежды, предметы быта, религиозного культа, декоративно-прикладного творчества этих народов. Наиболее полно представлена коллекция одежды, предметов быта и культа ненцев. Здесь выделяется уникальная зимняя ягушка, отороченная собачьим мехом, несколько отличающаяся по покрою от современной одежды ненцев, а также две ягушки, сшитые из меха белки, которые отличаются не только красотой и нарядностью, но и редкостью использования в быту.

Жемчужиной этнографической коллекции МВК является хантыйское платье из крапивного полотна, украшенное цветной нарядной вышивкой. В настоящее время подобные платья являются подлинной музейной редкостью, поскольку данный вид ткачества в хантыйской культуре был утрачен еще в конце XIX века.

В настоящее время идет планомерная комплектация фондов экспонатами по этнографии селькупов. В 2006 году сотрудниками МВК была предпринята историко-этнографическая экспедиция в Красноселькупский район ЯНАО, в ходе которой фонды пополнились новыми предметами быта селькупов, орудиями труда, зимней одеждой и обувью.